MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 29629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	CTT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465357
2	NC_021882	T	6	6	2283	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	526465357
3	NC_021882	T	6	6	2290	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	526465357
4	NC_021882	ACC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465357
5	NC_021882	TCA	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465357
6	NC_021882	TGA	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465358
7	NC_021882	TCA	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465358
8	NC_021882	A	6	6	4438	4443	100 %	0 %	0 %	0 %	526465358
9	NC_021882	CAAG	2	8	4472	4479	50 %	0 %	25 %	25 %	526465358
10	NC_021882	TCT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465358
11	NC_021882	T	6	6	4683	4688	0 %	100 %	0 %	0 %	526465358
12	NC_021882	GAAA	2	8	4701	4708	75 %	0 %	25 %	0 %	526465358
13	NC_021882	TCCAA	2	10	4773	4782	40 %	20 %	0 %	40 %	526465358
14	NC_021882	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526465358
15	NC_021882	A	6	6	5044	5049	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
16	NC_021882	TCA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465359
17	NC_021882	T	6	6	5058	5063	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
18	NC_021882	AAAG	2	8	5064	5071	75 %	0 %	25 %	0 %	526465359
19	NC_021882	T	6	6	5108	5113	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
20	NC_021882	A	6	6	5125	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
21	NC_021882	GC	3	6	5132	5137	0 %	0 %	50 %	50 %	526465359
22	NC_021882	CCG	2	6	5149	5154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526465359
23	NC_021882	A	7	7	5211	5217	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
24	NC_021882	A	6	6	5402	5407	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
25	NC_021882	CT	3	6	5463	5468	0 %	50 %	0 %	50 %	526465359
26	NC_021882	TTC	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465359
27	NC_021882	TC	3	6	5500	5505	0 %	50 %	0 %	50 %	526465359
28	NC_021882	A	7	7	5517	5523	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
29	NC_021882	GAC	2	6	5657	5662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465359
30	NC_021882	T	9	9	5729	5737	0 %	100 %	0 %	0 %	526465359
31	NC_021882	A	6	6	5754	5759	100 %	0 %	0 %	0 %	526465359
32	NC_021882	T	7	7	5938	5944	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
33	NC_021882	GAT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
34	NC_021882	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
35	NC_021882	T	6	6	6024	6029	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
36	NC_021882	T	7	7	6040	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
37	NC_021882	AGCG	2	8	6098	6105	25 %	0 %	50 %	25 %	526465360
38	NC_021882	ATG	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
39	NC_021882	GAGC	2	8	6250	6257	25 %	0 %	50 %	25 %	526465360
40	NC_021882	TTG	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465360
41	NC_021882	AGC	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465360
42	NC_021882	TGT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465360
43	NC_021882	T	7	7	6384	6390	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
44	NC_021882	GA	3	6	6399	6404	50 %	0 %	50 %	0 %	526465360
45	NC_021882	T	6	6	6416	6421	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
46	NC_021882	GAAT	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	526465360
47	NC_021882	GAA	2	6	6465	6470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465360
48	NC_021882	TC	3	6	6504	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	526465360
49	NC_021882	GGCGT	2	10	6528	6537	0 %	20 %	60 %	20 %	526465360
50	NC_021882	TGA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526465360
51	NC_021882	G	7	7	6621	6627	0 %	0 %	100 %	0 %	526465360
52	NC_021882	TGAT	2	8	6727	6734	25 %	50 %	25 %	0 %	526465360
53	NC_021882	TCA	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465360
54	NC_021882	A	7	7	6768	6774	100 %	0 %	0 %	0 %	526465360
55	NC_021882	ACC	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465360
56	NC_021882	TTTTC	2	10	6814	6823	0 %	80 %	0 %	20 %	526465360
57	NC_021882	CTA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465360
58	NC_021882	T	6	6	6888	6893	0 %	100 %	0 %	0 %	526465360
59	NC_021882	T	6	6	7083	7088	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
60	NC_021882	A	6	6	7147	7152	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
61	NC_021882	GCA	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465361
62	NC_021882	T	6	6	7370	7375	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
63	NC_021882	A	6	6	7384	7389	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
64	NC_021882	T	7	7	7391	7397	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
65	NC_021882	AAAC	2	8	7398	7405	75 %	0 %	0 %	25 %	526465361
66	NC_021882	GC	3	6	7408	7413	0 %	0 %	50 %	50 %	526465361
67	NC_021882	CT	3	6	7429	7434	0 %	50 %	0 %	50 %	526465361
68	NC_021882	A	6	6	7459	7464	100 %	0 %	0 %	0 %	526465361
69	NC_021882	T	7	7	7534	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
70	NC_021882	T	6	6	7568	7573	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
71	NC_021882	TGT	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526465361
72	NC_021882	AGAAAT	2	12	7626	7637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526465361
73	NC_021882	GTG	2	6	7726	7731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526465361
74	NC_021882	CTT	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465361
75	NC_021882	TTAGGG	2	12	7864	7875	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	526465361
76	NC_021882	TA	3	6	7914	7919	50 %	50 %	0 %	0 %	526465361
77	NC_021882	T	7	7	7922	7928	0 %	100 %	0 %	0 %	526465361
78	NC_021882	TTTC	2	8	8063	8070	0 %	75 %	0 %	25 %	526465362
79	NC_021882	ATC	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465362
80	NC_021882	CAG	2	6	8162	8167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526465362
81	NC_021882	GC	3	6	8174	8179	0 %	0 %	50 %	50 %	526465362
82	NC_021882	T	6	6	8187	8192	0 %	100 %	0 %	0 %	526465362
83	NC_021882	TCT	2	6	8290	8295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465362
84	NC_021882	TCT	3	9	8350	8358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465362
85	NC_021882	CAA	2	6	8375	8380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465362
86	NC_021882	T	6	6	8415	8420	0 %	100 %	0 %	0 %	526465362
87	NC_021882	TCT	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465362
88	NC_021882	T	7	7	8477	8483	0 %	100 %	0 %	0 %	526465362
89	NC_021882	A	6	6	8491	8496	100 %	0 %	0 %	0 %	526465362
90	NC_021882	A	6	6	8518	8523	100 %	0 %	0 %	0 %	526465362
91	NC_021882	TTC	2	6	8565	8570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465362
92	NC_021882	CGAT	2	8	8647	8654	25 %	25 %	25 %	25 %	526465362
93	NC_021882	CAATTC	2	12	8688	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465362
94	NC_021882	CAC	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465362
95	NC_021882	ATTG	2	8	8816	8823	25 %	50 %	25 %	0 %	526465362
96	NC_021882	GCTC	2	8	8841	8848	0 %	25 %	25 %	50 %	526465362
97	NC_021882	AATC	2	8	8853	8860	50 %	25 %	0 %	25 %	526465362
98	NC_021882	CCA	2	6	8879	8884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526465362
99	NC_021882	GCC	2	6	8933	8938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526465362
100	NC_021882	CT	3	6	8998	9003	0 %	50 %	0 %	50 %	526465362
101	NC_021882	T	6	6	9095	9100	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
102	NC_021882	TTC	2	6	9106	9111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465363
103	NC_021882	CAATGT	2	12	9198	9209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526465363
104	NC_021882	TAA	2	6	9237	9242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465363
105	NC_021882	GAA	3	9	9287	9295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526465363
106	NC_021882	CA	3	6	9302	9307	50 %	0 %	0 %	50 %	526465363
107	NC_021882	TCAA	2	8	9323	9330	50 %	25 %	0 %	25 %	526465363
108	NC_021882	TAA	2	6	9364	9369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465363
109	NC_021882	T	6	6	9404	9409	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
110	NC_021882	ACGC	2	8	9461	9468	25 %	0 %	25 %	50 %	526465363
111	NC_021882	CTT	2	6	9588	9593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465363
112	NC_021882	ATC	2	6	9607	9612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465363
113	NC_021882	AAT	2	6	9655	9660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465363
114	NC_021882	T	7	7	9822	9828	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
115	NC_021882	T	6	6	9835	9840	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
116	NC_021882	GGA	2	6	9869	9874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465363
117	NC_021882	AG	3	6	9884	9889	50 %	0 %	50 %	0 %	526465363
118	NC_021882	TTTTC	2	10	9918	9927	0 %	80 %	0 %	20 %	526465363
119	NC_021882	TCA	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526465363
120	NC_021882	G	7	7	10025	10031	0 %	0 %	100 %	0 %	526465363
121	NC_021882	CTT	2	6	10092	10097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465363
122	NC_021882	T	6	6	10128	10133	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
123	NC_021882	CTT	2	6	10167	10172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465363
124	NC_021882	CTTT	2	8	10181	10188	0 %	75 %	0 %	25 %	526465363
125	NC_021882	T	6	6	10186	10191	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
126	NC_021882	AAC	2	6	10241	10246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465363
127	NC_021882	T	6	6	10330	10335	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
128	NC_021882	CT	4	8	10361	10368	0 %	50 %	0 %	50 %	526465363
129	NC_021882	TAA	2	6	10369	10374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465363
130	NC_021882	TCT	2	6	10385	10390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526465363
131	NC_021882	ATTTT	2	10	10409	10418	20 %	80 %	0 %	0 %	526465363
132	NC_021882	CGCCTT	2	12	10434	10445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526465363
133	NC_021882	T	6	6	10468	10473	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
134	NC_021882	ATA	2	6	10508	10513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465363
135	NC_021882	AAACT	2	10	10515	10524	60 %	20 %	0 %	20 %	526465363
136	NC_021882	T	6	6	10554	10559	0 %	100 %	0 %	0 %	526465363
137	NC_021882	AAGA	2	8	10675	10682	75 %	0 %	25 %	0 %	526465364
138	NC_021882	T	6	6	10713	10718	0 %	100 %	0 %	0 %	526465364
139	NC_021882	AAT	2	6	10738	10743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526465364
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262	NC_021882	A	8	8	17733	17740	100 %	0 %	0 %	0 %	526465372
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274	NC_021882	CAA	2	6	18484	18489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465373
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396	NC_021882	AAC	2	6	23438	23443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526465379
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399	NC_021882	GGA	2	6	23653	23658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526465379
400	NC_021882	T	7	7	23812	23818	0 %	100 %	0 %	0 %	526465379
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